RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	APOBR	Q0VD83	1088 aa		16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	USP17L24	Q0WX57	530 aa		16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCTD1	Q719H9	257 aa		16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL17RA	Q96F46	866 aa		16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF2C	Q99661	725 aa		16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYL10	Q9BUA6	226 aa		16.02	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPRF	P10586	1907 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDHB	P11177	359 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	OSBP	P22059	807 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCAF4	Q8WV16	495 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	GMCL1	Q96IK5	515 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM232	C9JQI7	657 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	FLOT1	O75955	427 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP2C8	P10632	490 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	RXRA	P19793	462 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	MICU3	Q86XE3	530 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	PNMA3	Q9UL41	463 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		16	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRPA1	O75762	1119 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALDH1A1	P00352	501 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	RABEP1	Q15276	862 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBTB43	O43298	467 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CALM1	P0DP23	149 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CALM2	P0DP24	149 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CALM3	P0DP25	149 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	AK2	P54819	239 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	TROAP	Q12815	778 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	COG2	Q14746	738 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD1	Q15327	319 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	APOA5	Q6Q788	366 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXL16	Q8N461	479 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIFC2	Q96AC6	838 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	FEM1B	Q9UK73	627 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDAH1	O94760	285 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNHG28	P0DPA3	235 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC16A2	P36021	539 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	STAT2	P52630	851 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF543	Q08ER8	600 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF186	Q9NXI6	227 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ST18	O60284	1047 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBC1D8	O95759	1140 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF5B	P33176	963 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	FANCB	Q8NB91	859 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLRF2	D3W0D1	207 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CA12	O43570	354 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	HERVK_113	P62684	666 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	STK3	Q13188	491 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRHR2	Q13324	411 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRM4	Q14833	912 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM160B2	Q86V87	743 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPVL	Q9H3G5	476 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		15.96	■□□□□ 0.15
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
SELENBP1-208	ENST00000447402	DSG3	P32926	999 aa		15.95	■□□□□ 0.14

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