RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.041e-17■□□□□ 9.1
PRAME-208ENST00000438888 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 SWAP70Q9UH65 585 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 CYBAP13498 195 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 CASC1Q6TDU7 716 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 TICAM2Q86XR7 235 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 USP17L12C9JPN9 530 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 USP17L21D6R901 530 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 HIP1O00291 1037 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 MSCO60682 206 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 COBLO75128 1261 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 DSG3P32926 999 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 CDK8P49336 464 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 C8orf34Q49A92 452 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 LPAR1Q92633 364 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 SH2D4AQ9H788 454 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 VCPKMTQ9H867 229 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 DNM1LO00429 736 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 CHMLP26374 656 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 RTP1P59025 263 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 C12orf60Q5U649 245 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 TMX2Q9Y320 296 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 COL6A3P12111 3177 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 STRNO43815 780 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 MB21D1Q8N884 522 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 KBTBD13C9JR72 458 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 UBE3CQ15386 1083 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 CCDC17Q96LX7 622 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 MROH8Q9H579 483 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.77□□□□□ -0.04
PRAME-208ENST00000438888 DLL1O00548 723 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 SEPT4O43236 478 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 PGK2P07205 417 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 FCER1AP12319 257 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 CTR9Q6PD62 1173 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 FERMT2Q96AC1 680 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 MAML3Q96JK9 1138 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 MMP19Q99542 508 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 BACH2Q9BYV9 841 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 RAD50Q92878 1312 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 A0A0D9SFI3 127 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 IGHA2P01877 340 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 GPR153Q6NV75 609 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 APPBP2Q92624 585 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 FAM227BQ96M60 508 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 FAM161BQ96MY7 647 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 GOPCQ9HD26 462 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 MYH8P13535 1937 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 RLFQ13129 1914 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 SLC4A3P48751 1232 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 TRIM60Q495X7 471 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-208ENST00000438888 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms