RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SHISA4Q96DD7 197 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPATA32Q96LK8 384 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP28Q96RU2 1077 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KAT14Q9H8E8 782 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CABP5Q9NP86 173 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GGA3Q9NZ52 723 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ELP1O95163 1332 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EGFRP00533 1210 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SHMT1P34896 483 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PKN1Q16512 942 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SULF1Q8IWU6 871 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RGS22Q8NE09 1264 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PGBD1Q96JS3 809 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.38□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEXIO95424 95 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AKR1B1P15121 316 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNMA1Q8ND90 353 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WASF1Q92558 559 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GINM1Q9NU53 330 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STX8Q9UNK0 236 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNJ14Q9UNX9 436 aa11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LIG1P18858 919 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF5BP33176 963 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NF2P35240 595 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF445P59923 1031 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRM4Q14833 912 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BRAPQ7Z569 592 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.36□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTLL1O95922 423 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOVP48745 357 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP3K10Q02779 954 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM29Q14134 588 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATL3Q6DD88 541 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEP95Q96GE4 821 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP3K14Q99558 947 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAJC18Q9H819 358 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFAP45Q9UL16 551 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MTMR7Q9Y216 660 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLIC4Q9Y696 253 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM196BA6NMK8 535 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MMP1P03956 469 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNAQP50148 359 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TEPSINQ96N21 525 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SH2D4AQ9H788 454 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.35□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYH4Q9Y623 1939 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYCE3A1L190 88 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BTBD18B2RXH4 712 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASNSP08243 561 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CAP2P40123 477 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ICA1Q05084 483 aa11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms