RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 CCNA1P78396 465 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 LAMA4Q16363 1823 aa21.27■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 B4E1Z4 1266 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 KDM4AO75164 1064 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 CYP21A2P08686 494 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 MAPK4P31152 587 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 MB21D1Q8N884 522 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 MAP4K1Q92918 833 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 KRT23Q9C075 422 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 CASC1Q6TDU7 716 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ARMC5Q96C12 935 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 GMCL1Q96IK5 515 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 MGAMO43451 1857 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 MYH4Q9Y623 1939 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 BMP3P12645 472 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 MCCP23508 829 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 WDR78Q5VTH9 848 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 GPR142Q7Z601 462 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 NBPF11Q86T75 865 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 TTC14Q96N46 770 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 MTMR7Q9Y216 660 aa21.24■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 VWA5AO00534 786 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 GRK4P32298 578 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 SLC1A4P43007 532 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 IRF5Q13568 498 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 PLS1Q14651 629 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 IQCA1Q86XH1 822 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 FEM1BQ9UK73 627 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 GJD2Q9UKL4 321 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 RLFQ13129 1914 aa21.23■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 TRDNQ13061 729 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 KIFC2Q96AC6 838 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ZNF333Q96JL9 665 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.22■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 TMEM232C9JQI7 657 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ADCY3O60266 1144 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 SOX10P56693 466 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 KCTD1Q719H9 257 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 DGKHQ86XP1 1220 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 SLAIN1Q8ND83 568 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.21■□□□□ 0.99
HERC3-205ENST00000426683 E7EWF7 191 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 ELNP15502 786 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 ERCC3P19447 782 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 CYP2B6P20813 491 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 STAT2P52630 851 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 REPS2Q8NFH8 660 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 DCAF4Q8WV16 495 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 PTPREP23469 700 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 CCDC96Q2M329 555 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 MORN1Q5T089 497 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 FAM160B2Q86V87 743 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 TNKSO95271 1327 aa21.19■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 PARP14Q460N5 1801 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 ZBED4O75132 1171 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 STAT3P40763 770 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.18■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
HERC3-205ENST00000426683 NCOA7Q8NI08 942 aa21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms