RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413554.5

TNS1-204, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 1,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-204ENST00000413554 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa16.62■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.62■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 MTMR7Q9Y216 660 aa16.62■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.62■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L15C9J2P7 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L11C9JVI0 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L18D6R9N7 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L22D6RA61 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L19D6RCP7 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L20D6RJB6 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 DDAH1O94760 285 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 RCAN1P53805 252 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 ZNF543Q08ER8 600 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 USP17L24Q0WX57 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 IFNL1Q8IU54 200 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 ZBTB43O43298 467 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 PLA2G6O60733 806 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 CALM1P0DP23 149 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 CALM2P0DP24 149 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 CALM3P0DP25 149 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 GRM4Q14833 912 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 KCTD1Q719H9 257 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 FANCBQ8NB91 859 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 MYL10Q9BUA6 226 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.61■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 PDHXO00330 501 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 STAG2Q8N3U4 1231 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.6■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 TMEM232C9JQI7 657 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 ST18O60284 1047 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 RXRAP19793 462 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 COG2Q14746 738 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 MICU3Q86XE3 530 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 FEM1BQ9UK73 627 aa16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TNS1-204ENST00000413554 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 OSBPP22059 807 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 DSG3P32926 999 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 PPP2R5BQ15173 497 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 CCDC96Q2M329 555 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 HOXC10Q9NYD6 342 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.58■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 GOLGA8BA8MQT2 603 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 KLRF2D3W0D1 207 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 FLOT1O75955 427 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 KIF5BP33176 963 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 STAT2P52630 851 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 ME3Q16798 604 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 FAM160B2Q86V87 743 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 PNMA3Q9UL41 463 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 RLFQ13129 1914 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 NID2Q14112 1375 aa16.57■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 PFKFB2O60825 505 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 ALDH1A1P00352 501 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 CYP2C8P10632 490 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 SMARCA1P28370 1054 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 CDC27P30260 824 aa16.56■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 ADD1P35611 737 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TNS1-204ENST00000413554 RTN1Q16799 776 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms