RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC17Q96LX7 622 aa24.76■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 STXBP3O00186 592 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 CALML3P27482 149 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.76■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 SPDYE6P0CI01 402 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 SNHG28P0DPA3 235 aa24.75■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 SMARCA1P28370 1054 aa24.75■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 ATP2B2Q01814 1243 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 TTC38Q5R3I4 469 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 PIGSQ96S52 555 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 TIGD1Q96MW7 591 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF543Q08ER8 600 aa24.71■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.71■■□□□ 1.55
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SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.7■■□□□ 1.54
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SH3BP5-204ENST00000412806 GDF11O95390 407 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAPPC10P48553 1259 aa24.69■■□□□ 1.54
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SH3BP5-204ENST00000412806 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 CSRNP2Q9H175 543 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 BMP15O95972 392 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 SEPT2Q15019 361 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 NYAP2Q9P242 653 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 CNTNAP1P78357 1384 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP5-204ENST00000412806 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.67■■□□□ 1.54
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