RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF174Q15697 407 aa27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF827Q17R98 1081 aa27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 KANK3Q6NY19 840 aa27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 TC2NQ8N9U0 490 aa27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CARD6Q9BX69 1037 aa27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 GPSM2P81274 684 aa27.12■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.12■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ST7Q9NRC1 585 aa27.12■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC38Q5R3I4 469 aa27.12■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA20Q8TB22 786 aa27.12■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 EP400Q96L91 3159 aa27.11■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CASQ1P31415 396 aa27.11■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa27.11■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.11■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.11■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP3K9P80192 1104 aa27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 FERMT2Q96AC1 680 aa27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 DHX58Q96C10 678 aa27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 KAT14Q9H8E8 782 aa27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 NAV1Q8NEY1 1877 aa27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP4CP60510 307 aa27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 DGKHQ86XP1 1220 aa27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa27.1■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP8B1O43520 1251 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 BMP15O95972 392 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRP5P59047 1200 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 GNG11P61952 73 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CRY2Q49AN0 593 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 MED15Q96RN5 788 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L3A6NCW0 530 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L4A6NCW7 530 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF5BP33176 963 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 PLA2G4AP47712 749 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 PLCD1P51178 756 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 GSTO1P78417 241 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 PTGDRQ13258 359 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L1Q7RTZ2 530 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 PNMA1Q8ND90 353 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CERKQ8TCT0 537 aa27.09■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 BAG3O95817 575 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 GYS1P13807 737 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ADRA2BP18089 450 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ADKP55263 362 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKS1AQ92625 1134 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR24Q96S15 920 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa27.08■■□□□ 1.93
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC66A2RUB6 948 aa27.08■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 NR1I3Q14994 352 aa27.08■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.08■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 MRFAP1Q9Y605 127 aa27.08■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.07■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 MKNK2Q9HBH9 465 aa27.07■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 CD209Q9NNX6 404 aa27.07■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 UFL1O94874 794 aa27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1B0GTH6 734 aa27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 CASP1P29466 404 aa27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 AFMP43652 599 aa27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 KIFC2Q96AC6 838 aa27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 PAGE5Q96GU1 130 aa27.06■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC34Q96HJ3 373 aa27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINB2P05120 415 aa27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 GRM4Q14833 912 aa27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 PANX2Q96RD6 677 aa27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 AFF2P51816 1311 aa27.05■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 LDHCP07864 332 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY3P0CV98 308 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPY8P0CW00 308 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP2R3AQ06190 1150 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAPPC10P48553 1259 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 NT5C2P49902 561 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 IL17AQ16552 155 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
AMIGO1-201ENST00000369862 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms