RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365302.1

RNU6-1327P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1327, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1327P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1327P-201ENST00000365302 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 KRT37O76014 449 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 UPP2O95045 317 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 KCNH1O95259 989 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 MAP3K6O95382 1288 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 MED26O95402 600 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PRAMEF1O95521 474 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CRTAMO95727 393 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 BPNT1O95861 308 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CBX7O95931 251 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 S100BP04271 92 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ITGB2P05107 769 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CKMP06732 381 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 LPLP06858 475 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 THBDP07204 575 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CD3EP07766 207 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CELA3BP08861 270 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 JMJD7P0C870 316 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PF4V1P10720 104 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PYGMP11217 842 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ADH5P11766 374 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 OSMP13725 252 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PLS3P13797 630 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 EDN3P14138 238 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 EPB42P16452 691 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PTPRAP18433 802 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ATF3P18847 181 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 KRT15P19012 456 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 SLC9A1P19634 815 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ITIH2P19823 946 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 AMPD1P23109 780 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 FPR2P25090 351 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 TACR1P25103 407 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ITGB7P26010 798 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 HSD3B2P26439 372 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 NOS3P29474 1203 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 MC4RP32245 332 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 SOX18P35713 384 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 GRIK1P39086 918 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 STAT3P40763 770 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ECE1P42892 770 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CHRNA4P43681 627 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 KCNJ6P48051 423 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 TRAPPC10P48553 1259 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 DGKGP49619 791 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ZNF165P49910 485 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 DNM2P50570 870 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PTTG1IPP53801 180 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PMS1P54277 932 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CASP7P55210 303 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 SCAND1P57086 179 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 JAM2P57087 298 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 RHBDL3P58872 404 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ANAPC15P60006 121 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ERVFC1P60507 584 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 RPS26P62854 115 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 FGD1P98174 961 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 NFKB2Q00653 900 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 SLC7A5Q01650 507 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 GRIN1Q05586 938 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 TNK2Q07912 1038 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ITKQ08881 620 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 C19orf57Q0VDD7 668 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 SCRN1Q12765 414 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 NFIAQ12857 509 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 GRB10Q13322 594 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 TUSC3Q13454 348 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 AUHQ13825 339 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 STAT4Q14765 748 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 GRM3Q14832 879 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PDCD1Q15116 288 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 LLGL1Q15334 1064 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 FXNQ16595 210 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ELOA3BQ3SY89 546 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 TIGD5Q53EQ6 642 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 CT83Q5H943 113 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 TOR2AQ5JU69 321 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 IFFO2Q5TF58 517 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1327P-201ENST00000365302 PIK3R6Q5UE93 754 aa0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms