RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 ECM29Q5VYK3 1845 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CLRN2A0PK11 232 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CUTAO60888 179 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PTPREP23469 700 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 RCAN1P53805 252 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PPP2R5BQ15173 497 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 INF2Q27J81 1249 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TTC38Q5R3I4 469 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 KCTD1Q719H9 257 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SNED1Q8TER0 1413 aa11.63□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 GDF11O95390 407 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 GRM4Q14833 912 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 COA7Q96BR5 231 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 HPSEQ9Y251 543 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 YDJCA8MPS7 323 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PODNQ7Z5L7 613 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SLX4Q8IY92 1834 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PP2D1A8MPX8 630 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 NAPAP54920 295 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SNAP25P60880 206 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 DACT2Q5SW24 774 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 BLIDQ8IZY5 108 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 MYH6P13533 1939 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 DPEP1P16444 411 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 ATP1A3P13637 1013 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SHMT1P34896 483 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 ZNF75DP51815 510 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 RGS22Q8NE09 1264 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TNFRSF25Q93038 417 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 DNAJC18Q9H819 358 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TMEM260Q9NX78 707 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.61□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 BMP6P22004 513 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 IL17AQ16552 155 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CCDC96Q2M329 555 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CNKSR1Q969H4 720 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SMC2O95347 1197 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PDHBP11177 359 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 GABPAQ06546 454 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.6□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 SMCO2A6NFE2 343 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 LETM2Q2VYF4 491 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 STYK1Q6J9G0 422 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PCNTO95613 3336 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 STXBP3O00186 592 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 HLA-DOAP06340 250 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 NLRP12P59046 1061 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 POSTNQ15063 836 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 CFAP100Q494V2 611 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 GJA10Q969M2 543 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.59□□□□□ -0.55
PSME3-201ENST00000293362 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 681.6 ms