RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270560.3

TM4SF5-201, Transcript of transmembrane 4 L six family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM4SF5, Length 708 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5-201ENST00000270560 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.46■■□□□ 1.51
TM4SF5-201ENST00000270560 GMCL1Q96IK5 515 aa24.46■■□□□ 1.51
TM4SF5-201ENST00000270560 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TM4SF5-201ENST00000270560 BTBD7Q9P203 1132 aa24.46■■□□□ 1.51
TM4SF5-201ENST00000270560 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.46■■□□□ 1.51
TM4SF5-201ENST00000270560 MAPK4P31152 587 aa24.45■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 TRDNQ13061 729 aa24.45■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.45■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.45■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 BMP3P12645 472 aa24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 DGKHQ86XP1 1220 aa24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 ATG4CQ96DT6 458 aa24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 LAMA4Q16363 1823 aa24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC1A4P43007 532 aa24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 PRKCZQ05513 592 aa24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 FEM1BQ9UK73 627 aa24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 MCCP23508 829 aa24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 RAET1EQ8TD07 263 aa24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 ANKS1AQ92625 1134 aa24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 PORCNQ9H237 461 aa24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 E7EWF7 191 aa24.41■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 VWA5AO00534 786 aa24.41■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 FLT3LGP49771 235 aa24.41■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 DCAF4Q8WV16 495 aa24.41■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.41■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 GABRQQ9UN88 632 aa24.41■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 IRF5Q13568 498 aa24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 NECTIN1Q15223 517 aa24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 NCOA7Q8NI08 942 aa24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5-201ENST00000270560 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 TMEM232C9JQI7 657 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 PLA2G6O60733 806 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 STAT2P52630 851 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 GPR142Q7Z601 462 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 NBPF11Q86T75 865 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 FAM160B2Q86V87 743 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 ARMC5Q96C12 935 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 GJD2Q9UKL4 321 aa24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 TNKSO95271 1327 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC27A2O14975 620 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 PLS1Q14651 629 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 RNF20Q5VTR2 975 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 REPS2Q8NFH8 660 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 KIFC2Q96AC6 838 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 ZBED4O75132 1171 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 FDX1P10109 184 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 KCTD1Q719H9 257 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 MROH8Q9H579 483 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 KAT14Q9H8E8 782 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 MTMR7Q9Y216 660 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 HTTP42858 3142 aa24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC25A27O95847 323 aa24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 GRK4P32298 578 aa24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 CCDC96Q2M329 555 aa24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 WDR78Q5VTH9 848 aa24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 RLFQ13129 1914 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 MYH4Q9Y623 1939 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 ADCY3O60266 1144 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 SNHG28P0DPA3 235 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 PDHBP11177 359 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 ERCC3P19447 782 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 COPB2P35606 906 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 STAT3P40763 770 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 MORN1Q5T089 497 aa24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5-201ENST00000270560 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms