RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258774.9

HUS1-201, Transcript of HUS1 checkpoint clamp component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HUS1, Length 2,935 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HUS1-201ENST00000258774 CUL4BQ13620 913 aa8.71□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.71□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.71□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.71□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 KRT23Q9C075 422 aa8.71□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.71□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 VPS18Q9P253 973 aa8.71□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CTAGE9A4FU28 777 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CTSWP56202 376 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 HLFQ16534 295 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 HDXQ7Z353 690 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 PAGE5Q96GU1 130 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ABCB6Q9NP58 842 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 GYPCP04921 128 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 TDO2P48775 406 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 STAMQ92783 540 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 PSMD1Q99460 953 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 RAB21Q9UL25 225 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CHD4Q14839 1912 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ERICH2A1L162 156 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 TRIM75PA6NK02 468 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 POTEB2H3BUK9 544 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SNAP23O00161 211 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 GNPATO15228 680 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 PDE8AO60658 829 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ERLIN1O75477 346 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 USP5P45974 858 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SLC20A2Q08357 652 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SPATA5Q8NB90 893 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 FANCBQ8NB91 859 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SHISA4Q96DD7 197 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.7□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 NID2Q14112 1375 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CDC25AP30304 524 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 VSNL1P62760 191 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ERVK-24P63145 666 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 MAP3K12Q12852 859 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 DPYDQ12882 1025 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CNGA4Q8IV77 575 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 LCORLQ8N3X6 602 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 L1RE1Q9UN81 338 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 WNT7AO00755 349 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SLC34A2O95436 690 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 ACTN2P35609 894 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 RASGRF1Q13972 1273 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 FAM182BQ5T319 152 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 MYH8P13535 1937 aa8.69□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 TRIM66O15016 1216 aa8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 PRDM1O75626 825 aa8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CTAGE8P0CG41 777 aa8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 GYS1P13807 737 aa8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HUS1-201ENST00000258774 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms