RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 USP6NLQ92738 828 aa24.89■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.89■■□□□ 1.58
CITED1-201ENST00000246139 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 CAPN2P17655 700 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 PTPREP23469 700 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 CCL14Q16627 93 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 VPS53Q5VIR6 699 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 MB21D1Q8N884 522 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 APBA2Q99767 749 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 ATG4CQ96DT6 458 aa24.87■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.87■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 NYAP2Q9P242 653 aa24.87■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 EVI5O60447 810 aa24.86■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.86■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 ERCC3P19447 782 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 SDSP20132 328 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 COL6A3P12111 3177 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 TSPY3P0CV98 308 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 TSPY8P0CW00 308 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 GRB14Q14449 540 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 ALX1Q15699 326 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 DPP9Q86TI2 863 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.84■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 F5H6K3 240 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 STRNO43815 780 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 TFAP4Q01664 338 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 KLRC3Q07444 240 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 CEP95Q96GE4 821 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-201ENST00000246139 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 PDE4AP27815 886 aa24.82■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.82■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 MROH8Q9H579 483 aa24.82■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.82■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.82■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 A0A0C4DFX4 3053 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 FGAP02671 866 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 ADORA2AP29274 412 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 MKL1Q969V6 931 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 INCENPQ9NQS7 918 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 TTLL1O95922 423 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 NDUFB10O96000 172 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 HOXC6P09630 235 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 TSPY2A6NKD2 308 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 HIP1O00291 1037 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 VWA5AO00534 786 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 SLC25A27O95847 323 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 FCER1AP12319 257 aa24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 CNGA1P29973 690 aa24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 STAT3P40763 770 aa24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.78■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 CYP2C19P33261 490 aa24.77■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 LRCH3Q96II8 777 aa24.77■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 NBPF3Q9H094 633 aa24.77■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 ZMYM6O95789 1325 aa24.77■■□□□ 1.56
CITED1-201ENST00000246139 RLFQ13129 1914 aa24.76■■□□□ 1.55
CITED1-201ENST00000246139 COBLO75128 1261 aa24.76■■□□□ 1.55
CITED1-201ENST00000246139 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.76■■□□□ 1.55
CITED1-201ENST00000246139 TTC22Q5TAA0 569 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms