RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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PANX1-201ENST00000227638 SLURP2P0DP57 97 aa20.48■□□□□ 0.87
PANX1-201ENST00000227638 UBXN1Q04323 297 aa20.48■□□□□ 0.87
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PANX1-201ENST00000227638 FERMT2Q96AC1 680 aa20.48■□□□□ 0.87
PANX1-201ENST00000227638 GSDMAQ96QA5 445 aa20.48■□□□□ 0.87
PANX1-201ENST00000227638 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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PANX1-201ENST00000227638 BCORQ6W2J9 1755 aa20.48■□□□□ 0.87
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