RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ctdspl2Q8BG15 465 aa16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Apol11aE9PZG0 334 aa16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pde8bE9Q4S1 865 aa16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 DbnlQ62418 436 aa16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AlkP97793 1621 aa16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Clrn2B2RVW2 232 aa16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm5168Q4KL04 211 aa16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Efcc1Q9JJF6 558 aa16.88■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kiaa1841Q68FF0 718 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kif11Q6P9P6 1052 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pex11aQ9Z211 246 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kmt5aQ2YDW7 349 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt87Q6IMF0 495 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cdc26Q99JP4 85 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam114a1Q9D281 569 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trmt44Q9D2Q2 713 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Map3k7clP58500 142 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cct8l1Q80YT3 562 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mms19Q9D071 1031 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Yeats2Q3TUF7 1407 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt14Q61781 484 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ankrd45Q810N6 248 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp2a1Q8R429 994 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bpifb4A2BGH0 617 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt18P05784 423 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dhx37Q6NZL1 1150 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Depdc5P61460 1591 aa16.87■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nrbp2Q91V36 499 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pcdha7Q91Y13 937 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Abcc3B2RX12 1523 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AsphQ8BSY0 741 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atad3Q925I1 591 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp6v1e2Q9D593 226 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AdkP55264 361 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Micall1Q8BGT6 870 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Foxp1P58462 705 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hace1Q3U0D9 909 aa16.86■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sh2d4bA6X942 431 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tnnc2P20801 160 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cep63Q3UPP8 700 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm5169Q5M8P2 212 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pank4Q80YV4 820 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bola2Q8BGS2 86 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Apol7cQ8C6E1 369 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 C130026I21RikQ8C898 291 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trmt112Q9DCG9 125 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Strn3Q9ERG2 796 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Suclg2Q9Z2I8 433 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Psma7Q9Z2U0 248 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MypnQ5DTJ9 1315 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm1661E9Q963 441 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CaluO35887 315 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stmn2P55821 179 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Snap25P60879 206 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ncoa4Q5U4H9 625 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 KhnynQ80U38 671 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bola3Q8CEI1 110 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt8P11679 490 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q3TTJ4 293 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Znf526Q8BI66 675 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AacsQ9D2R0 672 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Serpinb12Q9D7P9 423 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt71Q9R0H5 524 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SrprbP47758 269 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cyp2c67Q569X9 491 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rsph3bQ9DA80 389 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trap1aP19473 224 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ItkQ03526 625 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Esyt2Q3TZZ7 845 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SkiQ60698 725 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atad2Q8CDM1 1040 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sdr42e1Q9D665 394 aa16.85■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mnat1P51949 309 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stk32bQ9JJX8 414 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Btn2a2A4QPC6 514 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Spata2Q8K004 515 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp174B9EJW5 407 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc13D3YV10 709 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gngt1Q61012 74 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MmeQ61391 750 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zbtb7bQ64321 544 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rbm41Q8JZV4 413 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bmp2kQ91Z96 1138 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gja10Q9WUS4 505 aa16.84■□□□□ 0.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.9 ms