RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022228.12

Cwc27-201, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cwc27, Length 2,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Gbp4Q61107 620 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Sycp1Q62209 993 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Eif3j2Q66JS6 263 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 AtripQ8BMG1 785 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Irgm2A0A140LIF8 407 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Ano3A2AHL1 981 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Nf2P46662 596 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 PcQ05920 1178 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Cnnm2Q3TWN3 875 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 EngaseQ8BX80 734 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Atad2Q8CDM1 1040 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Shtn1Q8K2Q9 631 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Bap1Q99PU7 728 aa14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Med23Q80YQ2 1367 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Vmn2r68L7N2B3 851 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Ddr1Q03146 911 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Znf667Q2TL60 609 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Rassf10Q8BL43 508 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Zbtb43Q9DAI4 467 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tmem165P52875 323 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Fzd9Q9R216 592 aa14.69□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa14.68□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Ccdc174Q3U155 467 aa14.68□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Znf24Q91VN1 368 aa14.68□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Zfp213E9QAW0 468 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Actn3O88990 900 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tnni2P13412 182 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Pald1P70261 859 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 VrtnQ3SYK4 740 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tmprss11eQ5S248 423 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Slc44a1Q6X893 653 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Hps6Q8BLY7 805 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Ccdc80Q8R2G6 949 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Dact1Q8R4A3 778 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 4930550L24RikQ99PA7 320 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 ErmapQ9JLN5 566 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Cry2Q9R194 592 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Sap30bpQ02614 308 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tex11Q14AT2 947 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Scnn1aQ61180 699 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Mei1Q9D4I2 1268 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tubb4aQ9D6F9 444 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Efcc1Q9JJF6 558 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Mkrn1Q9QXP6 481 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Atrnl1Q6A051 1378 aa14.67□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Dnajc21E9Q8D0 531 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Abl1P00520 1123 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Il7P10168 154 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Gjb2Q00977 226 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Zfp51Q3U4L8 781 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Klrg2Q3UM83 387 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Scaf8Q6DID3 1268 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Znf513Q6PD29 541 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tmem39bQ810L4 492 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Exd1Q8CDF7 570 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Atxn7Q8R4I1 867 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Znf287Q9EQB9 759 aa14.66□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 1700003F12RikA2AKE5 210 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Slc4a9E9PUP3 929 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Psen2Q61144 448 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Gm21985Q6P6P5 1106 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tti2Q8BGV4 512 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Sp8Q8BMJ8 486 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tmx1Q8VBT0 278 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Cdca7lQ922M5 438 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Dynll2Q9D0M5 89 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 A0A1W2P6Q8 802 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 A0A1W2P7Z8 802 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Gm9046A0A1W2P855 802 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Slc1a4O35874 532 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Lgr6Q3UVD5 967 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Ncaph2Q8BSP2 607 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Ccz1Q8C1Y8 480 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Dnaaf4Q8R368 420 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Cdk8Q8R3L8 464 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Cep89Q9CZX2 791 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Q9D9S1 216 aa14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Myh14Q6URW6 2000 aa14.64□□□□□ -0.07
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Gm29094F6Q785 221 aa14.64□□□□□ -0.07
Cwc27-201ENSMUST00000022228 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.7 ms