RNA–Protein interactions for RNA: YGR058W

PEF1, Transcript of Penta-EF-hand protein, yeast

Gene PEF1, Length 1,008 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEF1	YGR058W	SRB8	P25648	1427 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	BUD3	P25558	1636 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	RGT1	P32862	1170 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	UBX6	P47049	396 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	TEP1	P53916	434 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	GTB1	Q04924	702 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	NDD1	Q08887	554 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	SUL2	Q12325	893 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	POL3	P15436	1097 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	APM3	P38153	483 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	BUD16	P39988	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	PIG1	Q06216	648 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	MCH4	Q08268	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PEF1	YGR058W	MET30	P39014	640 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YAT2	P40017	923 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	QRI7	P43122	407 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	MSY1	P48527	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	ATG21	Q02887	496 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	PET122	P10355	254 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	PCT1	P13259	424 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	GPA1	P08539	472 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YCR006C	P25350	157 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	SPC72	P39723	622 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YIL169C	P40442	995 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	VPS25	P47142	202 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	IMA1	P53051	589 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
PEF1	YGR058W	MET14	Q02196	202 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	CAC2	Q04199	468 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	STP3	Q05937	343 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	FRE3	Q08905	711 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	PIF1	P07271	859 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	BIK1	P11709	440 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	MNN2	P38069	597 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	PHM8	P40025	321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	IZH1	Q03419	316 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	HIM1	Q06674	414 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	BAG7	Q12128	409 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	GCN2	P15442	1659 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YSP3	P25036	478 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YKL133C	P36066	463 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	PCL6	P40038	420 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	SKP2	P42843	763 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	UBP8	P50102	471 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	MLC2	Q06580	163 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	GRS2	Q06817	618 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	NRT1	Q08485	598 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	GAL1	P04385	528 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	MSS18	P08593	268 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	YBR138C	P38277	524 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	HIS6	P40545	261 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	DJP1	P40564	432 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	ZAP1	P47043	880 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	BET4	Q00618	327 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	SWF1	Q04629	336 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PEF1	YGR058W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	ARP9	Q05123	467 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	POS5	Q06892	414 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	YND1	P40009	630 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	ASG1	P40467	964 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	ERR3	P42222	437 aa		4.01	□□□□□ -1.77
PEF1	YGR058W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77

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