RNA–Protein interactions for RNA: YGR039W

YGR039W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGR039W, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR039W	YGR039W	VPS33	P20795	691 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	YCK1	P23291	538 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	ERG8	P24521	451 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	DPH2	P32461	534 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	PES4	P39684	611 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	BUD16	P39988	312 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	LRO1	P40345	661 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	JEM1	P40358	645 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	YJL068C	P40363	299 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	ZAP1	P47043	880 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	AAD10	P47182	288 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	COQ6	P53318	479 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	INN1	P53901	409 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	ZDS2	P54786	942 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	MFM1	Q02783	413 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	RAD30	Q04049	632 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	GEP3	Q08622	556 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	HUA2	Q12134	243 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	FRE7	Q12333	620 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGR039W	YGR039W	PMS1	P14242	873 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	OCA4	P25366	362 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	CNE1	P27825	502 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	DBF4	P32325	704 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	ALY1	P36117	915 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	SRO77	P38163	1010 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	UBP13	P38187	747 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	MET18	P40469	1032 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	COS12	P53053	380 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	ATP23	P53722	227 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	MUB1	Q03162	620 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	STP3	Q05937	343 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YCR061W	P25639	631 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	RPC34	P32910	317 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YJL193W	P39542	402 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YEL057C	P39983	233 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	BUD17	P53727	317 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	JJJ1	P53863	590 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	RMT2	Q03305	412 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	ARP9	Q05123	467 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	TMA16	Q08687	178 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	PGC1	Q08959	321 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	RCN2	Q12044	265 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	CTT1	P06115	562 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	AQY1	P0CD91	305 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	SEC12	P11655	471 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	WHI2	P12611	486 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	CBS1	P14066	229 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	ADK2	P26364	225 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	URK1	P27515	501 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	DSS4	P32601	143 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	RXT2	P38255	430 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	APD1	P38281	316 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	SLZ1	P40167	298 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	UBP7	P40453	1071 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	DJP1	P40564	432 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	NMD5	P46970	1048 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	ASE1	P50275	885 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	SGF73	P53165	657 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	NNF2	P53253	936 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YML119W	Q03208	357 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	SPE4	Q12455	300 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	LOT5	P34234	306 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YBL029W	P38201	376 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	SMF1	P38925	575 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	CCT6	P39079	546 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	RGI2	P40188	164 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	SNO3	P43544	222 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	STB2	P46679	850 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	IDS2	P46958	469 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	BTN2	P53286	410 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YPL272C	Q08984	517 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	CYB2	P00175	591 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	YML003W	P0CF16	290 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	APE1	P14904	514 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR039W	YGR039W	GSY2	P27472	705 aa		3.42	□□□□□ -1.86

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