RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175		Q96M66	194 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	GJB6	O95452	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CYP7A1	P22680	504 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	NCAPH	Q15003	741 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ITGB7	P26010	798 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	PIF1	Q9H611	641 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	LRRN2	O75325	713 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	DDAH1	O94760	285 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	CEACAM5	P06731	702 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	FURIN	P09958	794 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	SRF	P11831	508 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	TNK2	Q07912	1038 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	HAUS7	Q99871	368 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	SUSD5	O60279	629 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	FOSL1	P15407	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	PDPK1	O15530	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	CBX7	O95931	251 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	TGFB1	P01137	390 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	EPHX1	P07099	455 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	CD247	P20963	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	CLCN7	P51798	805 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATRX-223	ENST00000637175	EPN3	Q9H201	632 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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