RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-215ENST00000626257 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CCZ1B-215ENST00000626257 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CCZ1B-215ENST00000626257 PTGDRQ13258 359 aa30.02■■■□□ 2.4
CCZ1B-215ENST00000626257 SLC51AQ86UW1 340 aa30.02■■■□□ 2.4
CCZ1B-215ENST00000626257 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CCZ1B-215ENST00000626257 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.01■■■□□ 2.39
CCZ1B-215ENST00000626257 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa30■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 C12orf60Q5U649 245 aa30■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 KAT14Q9H8E8 782 aa29.99■■■□□ 2.39
CCZ1B-215ENST00000626257 ADAMTS3O15072 1205 aa29.98■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.97■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa29.96■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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CCZ1B-215ENST00000626257 PNMA1Q8ND90 353 aa29.95■■■□□ 2.39
CCZ1B-215ENST00000626257 ERO1AQ96HE7 468 aa29.95■■■□□ 2.39
CCZ1B-215ENST00000626257 MCM7P33993 719 aa29.95■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 HOMER1Q86YM7 354 aa29.95■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 L2HGDHQ9H9P8 463 aa29.95■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.94■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 NT5C2P49902 561 aa29.93■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 E2F4Q16254 413 aa29.93■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.93■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 ETF1P62495 437 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 A0A1B0GTH6 734 aa29.92■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 STX17P56962 302 aa29.92■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 IQUBQ8NA54 791 aa29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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CCZ1B-215ENST00000626257 STAMQ92783 540 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 USP17L3A6NCW0 530 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 USP17L4A6NCW7 530 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 ADKP55263 362 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-215ENST00000626257 GRM4Q14833 912 aa29.91■■■□□ 2.38
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