RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 C12orf60Q5U649 245 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 SHMT1P34896 483 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 GABPAQ06546 454 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 CTR9Q6PD62 1173 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 ABHD8Q96I13 439 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 SWAP70Q9UH65 585 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 PDCP20941 246 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 MOGSQ13724 837 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 WDR18Q9BV38 432 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR6Q9Y217 621 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 TLR2O60603 784 aa25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 TDO2P48775 406 aa25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 HMGCS2P54868 508 aa25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 SP3Q02447 781 aa25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.14■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 NECAB1Q8N987 351 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L10C9JJH3 530 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 BACE1P56817 501 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR2Q13614 643 aa25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 ERO1AQ96HE7 468 aa25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.12■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 C19orf81C9J6K1 198 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 CDK8P49336 464 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 PANK2Q9BZ23 570 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 LAMA4Q16363 1823 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 PTPRFP10586 1907 aa25.11■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 CYP2C8P10632 490 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 SBK1Q52WX2 424 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 FBXL16Q8N461 479 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 GTF3C6Q969F1 213 aa25.1■■□□□ 1.61
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SGMS1-210ENST00000619438 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 SMIM22K7EJ46 135 aa25.1■■□□□ 1.61
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SGMS1-210ENST00000619438 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 CPA4Q9UI42 421 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.1■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 TREML2Q5T2D2 321 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 Q6ZUG5 572 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 NAPBQ9H115 298 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.09■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 KIF22Q14807 665 aa25.08■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 SEPT2Q15019 361 aa25.08■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF6Q15052 776 aa25.08■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC17Q96LX7 622 aa25.08■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 PNMA3Q9UL41 463 aa25.08■■□□□ 1.61
SGMS1-210ENST00000619438 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM17Q9Y577 477 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 E7EWF7 191 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 OSBPP22059 807 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 C17orf99Q6UX52 265 aa25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 TCHHQ07283 1943 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 EFCC1Q9HA90 598 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SGMS1-210ENST00000619438 HTTP42858 3142 aa25.06■■□□□ 1.6
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