RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	RWDD2B	P57060	319 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF609	O15014	1411 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A0U1RQJ8	604 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CDC27	P30260	824 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	PTPA	Q15257	358 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	TCP11	Q8WWU5	503 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CAVIN3	Q969G5	261 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	UTY	O14607	1347 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	LSP1	P33241	339 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF790	Q6PG37	636 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	SLIT2	O94813	1529 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	MYL6B	P14649	208 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	FUK	Q8N0W3	1084 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	MMS19	Q96T76	1030 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM107A	O95990	144 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	EPHB4	P54760	987 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	KANK3	Q6NY19	840 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA20	Q8TB22	786 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	PIGB	Q92521	554 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	DCAF5	Q96JK2	942 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	POSTN	Q15063	836 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	DDB1	Q16531	1140 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	LONRF3	Q496Y0	759 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA1	Q5VX52	437 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CD302	Q8IX05	232 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CPEB1-215	ENST00000617958	HSF2BP	O75031	334 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP1R37	O75864	691 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	GYPC	P04921	128 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	MYBL2	P10244	700 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	XRCC4	Q13426	336 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	PTGIS	Q16647	500 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	TTMP	Q5BVD1	217 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	RUFY1	Q96T51	708 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	ERVK-24	P63145	666 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAF1	Q13077	416 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	PDCL	Q13371	301 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM228A	Q86W67	206 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	MAP3K14	Q99558	947 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	KIF28P	B7ZC32	967 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	TEX33	O43247	280 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	CASP14	P31944	242 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	PALLD	Q8WX93	1383 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	DISP2	A7MBM2	1401 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CPEB1-215	ENST00000617958	MGRN1	O60291	552 aa		12.01	□□□□□ -0.49

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