RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	TNFAIP3	P21580	790 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PEX26	Q7Z412	305 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CSRNP2	Q9H175	543 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806		H7C1D1	291 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MYO1C	O00159	1063 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ALDH3A1	P30838	453 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	UIMC1	Q96RL1	719 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CASP8	Q14790	479 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MTMR3	Q13615	1198 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	VSIG1	Q86XK7	387 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	KCNK3	O14649	394 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	USP37	Q86T82	979 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	POLA2	Q14181	598 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	E2F4	Q16254	413 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	APOA5	Q6Q788	366 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	EPC1	Q9H2F5	836 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MAST3	O60307	1309 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PDE8A	O60658	829 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ATP5D	P30049	168 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GUCY2D	Q02846	1103 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PTGDR	Q13258	359 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SASH1	O94885	1247 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PDE6A	P16499	860 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PPARA	Q07869	468 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ZBTB22	O15209	634 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	FLOT1	O75955	427 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	AIFM3	Q96NN9	605 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GSDMA	Q96QA5	445 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SETDB2	Q96T68	719 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC63	Q8NA47	563 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MGARP	Q8TDB4	240 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	STMN2	Q93045	179 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SYNC	Q9H7C4	482 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TBX22	Q9Y458	520 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TNKS	O95271	1327 aa		12.41	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	IFT88	Q13099	833 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		12.4	□□□□□ -0.42

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