RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ITGA6	P23229	1130 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ASIC1	P78348	528 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	TCIRG1	Q13488	830 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	DOCK2	Q92608	1830 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CLCN6	P51797	869 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ANO9	A1A5B4	782 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	USP5	P45974	858 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ZPR1	O75312	459 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	MNAT1	P51948	309 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	C8orf74	Q6P047	294 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CLSTN1	O94985	981 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ATRN	O75882	1429 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	TADA3	O75528	432 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	PNOC	Q13519	176 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	DHX58	Q96C10	678 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	TSPY3	P0CV98	308 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	TSPY8	P0CW00	308 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ACTN2	P35609	894 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	AFM	P43652	599 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SLC20A2	Q08357	652 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	FANCB	Q8NB91	859 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	PPFIA4	O75335	1185 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	DES	P17661	470 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	MORC3	Q14149	939 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CENPH	Q9H3R5	247 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	FANCL	Q9NW38	375 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CYP7A1	P22680	504 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ANXA13	P27216	316 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	KRT9	P35527	623 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	NELFB	Q8WX92	580 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	IFT74	Q96LB3	600 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	MBD4	O95243	580 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CNPY4	Q8N129	248 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SPAG5	Q96R06	1193 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	PDE8B	O95263	885 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CUL5	Q93034	780 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	THAP9	Q9H5L6	903 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	CUL1	Q13616	776 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	7.42	□□□□□ -1.22	1e-6	■■□□□ 14.1
ACACA-231	ENST00000614428	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428		A0A1B0GUA9	196 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SASH1	O94885	1247 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	EPHB4	P54760	987 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	SLC39A6	Q13433	755 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-231	ENST00000614428	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		7.42	□□□□□ -1.22

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