RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CRCPO75575 148 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 USTQ9Y2C2 406 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF6Q15052 776 aa22.39■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 BEND3Q5T5X7 828 aa22.39■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 KRT222Q8N1A0 295 aa22.39■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SLFN13Q68D06 897 aa22.39■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.39■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.39■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SORBS3O60504 671 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 JAK2O60674 1132 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 FANCCQ00597 558 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 KLRF2D3W0D1 207 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 GPBP1Q86WP2 473 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TNKSO95271 1327 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM232C9JQI7 657 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 SEMA3EO15041 775 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 GEN1Q17RS7 908 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TUBBP07437 444 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 XKR9Q5GH70 373 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ERCC3P19447 782 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 MYOM2P54296 1465 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 PDE8BO95263 885 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 STIM2Q9P246 746 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 GNA14O95837 355 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 LIG4P49917 911 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 FANCBQ8NB91 859 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 RDH13Q8NBN7 331 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CCNA1P78396 465 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 BIRC2Q13490 618 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ABCC4O15439 1325 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CLRN2A0PK11 232 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 DDAH1O94760 285 aa22.36■■□□□ 1.17
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CTDP1-208ENST00000613122 ANO3Q9BYT9 981 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ATP5DP30049 168 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 KCTD2Q14681 263 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CLUL1Q15846 466 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF3Q9H094 633 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 H0YCG3 227 aa22.36■■□□□ 1.17
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CTDP1-208ENST00000613122 MED10Q9BTT4 135 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 METP08581 1390 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 STAMQ92783 540 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 GTF3C6Q969F1 213 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 GALNT17Q6IS24 598 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 A0A0D9SFI3 127 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TECP42680 631 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 SWAP70Q9UH65 585 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 BBOX1O75936 387 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 OSBPP22059 807 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 DPP9Q86TI2 863 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CSRNP1Q96S65 589 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TMOD1P28289 359 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 NEK8Q86SG6 692 aa22.34■■□□□ 1.17
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