RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 NLRP12P59046 1061 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 BEND4Q6ZU67 534 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 SYT17Q9BSW7 474 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 ADAM19Q9H013 955 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 CHD4Q14839 1912 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 PALLDQ8WX93 1383 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 C4AP0C0L4 1744 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 H3BRJ5 948 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 IL13P35225 146 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 ITPK1Q13572 414 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 WDR64B1ANS9 1081 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 TRPA1O75762 1119 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 WNT11O96014 354 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 HGSNATQ68CP4 663 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 HHIPQ96QV1 700 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 ELP3Q9H9T3 547 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 ATG3Q9NT62 314 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 CNTN3Q9P232 1028 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 RNF208Q9H0X6 261 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 A6NHS1 94 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 FAM177BA6PVY3 158 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 H3BRB1 525 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 NFKBIEO00221 500 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 EDEM1Q92611 657 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 SPG7Q9UQ90 795 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 MRC1P22897 1456 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 SGO2Q562F6 1265 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 FDX2Q6P4F2 183 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 MORC1Q86VD1 984 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-212ENST00000597259 MTHFSP49914 203 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 CABP4P57796 275 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 ECM1Q16610 540 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 ABI1Q8IZP0 508 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 WNT8BQ93098 351 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 MTMR7Q9Y216 660 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 FZD6O60353 706 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 ICMTO60725 284 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 PDGFAP04085 211 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 NPR3P17342 541 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 YY1P25490 414 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 SHISA5Q8N114 240 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 FBXL6Q8N531 539 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 LGR6Q9HBX8 967 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 PIM2Q9P1W9 311 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 SOX13Q9UN79 622 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 POLIQ9UNA4 740 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 F13BP05160 661 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms