RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763	ORC4	O43929	436 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TROAP	Q12815	778 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	STX1A	Q16623	288 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	IL17RA	Q96F46	866 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	FSD2	A1L4K1	749 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	GH2	P01242	217 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	SEPT2	Q15019	361 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	STYK1	Q6J9G0	422 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	BLID	Q8IZY5	108 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	NUP98	P52948	1817 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PSMD14	O00487	310 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	GNA11	P29992	359 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PTGDR	Q13258	359 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	SLC39A14	Q15043	492 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	SBK1	Q52WX2	424 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	NBPF11	Q86T75	865 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TTLL1	O95922	423 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PPP4C	P60510	307 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PNOC	Q13519	176 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CPXCR1	Q8N123	301 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	SMARCE1	Q969G3	411 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TXK	P42681	527 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	SEC23A	Q15436	765 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	SLFN13	Q68D06	897 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	ELP1	O95163	1332 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	STX17	P56962	302 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	NTRK3	Q16288	839 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	KIFC2	Q96AC6	838 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	IDE	P14735	1019 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC174	Q6PII3	467 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CBX8	Q9HC52	389 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TMEM232	C9JQI7	657 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF592	Q92610	1267 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	RHBDL3	P58872	404 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CSRNP2	Q9H175	543 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	CUTA	O60888	179 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	STAT6	P42226	847 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	EVC	P57679	992 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	EPSTI1	Q96J88	318 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
ILF3-222	ENST00000592763	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ILF3-222	ENST00000592763	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
ILF3-222	ENST00000592763	CLSTN1	O94985	981 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ILF3-222	ENST00000592763	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ILF3-222	ENST00000592763	CMA1	P23946	247 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ILF3-222	ENST00000592763	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.33	□□□□□ -0.44
ILF3-222	ENST00000592763	UBE2S	Q16763	222 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ILF3-222	ENST00000592763	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
ILF3-222	ENST00000592763	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		12.33	□□□□□ -0.44

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