RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591914.5

SMAD4-213, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 992 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-213	ENST00000591914	ERVK-9	P63128	1117 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914	ERVK-24	P63145	666 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914	PPARA	Q07869	468 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914	PDE4A	P27815	886 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914		Q3C1V9	767 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SMAD4-213	ENST00000591914	POTEF	A5A3E0	1075 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	PRDM1	O75626	825 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	SDS	P20132	328 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	ALX1	Q15699	326 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	CNMD	O75829	334 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	ATP2B2	Q01814	1243 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	PDE4B	Q07343	736 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	GJD2	Q9UKL4	321 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	RLF	Q13129	1914 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	ADCY3	O60266	1144 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	COG2	Q14746	738 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	NYAP2	Q9P242	653 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	MAPK4	P31152	587 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	PORCN	Q9H237	461 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	PLXNB2	O15031	1838 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	GOPC	Q9HD26	462 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	BTBD7	Q9P203	1132 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914		A0A0G2JMZ2	1700 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	ZMYM6	O95789	1325 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SMAD4-213	ENST00000591914	PARP14	Q460N5	1801 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	ELN	P15502	786 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	MTFR1	Q15390	333 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	FGA	P02671	866 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	CCNA1	P78396	465 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	CEP95	Q96GE4	821 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	HIP1	O00291	1037 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	FLOT1	O75955	427 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	DSG3	P32926	999 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	UBXN2A	P68543	259 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	GPR142	Q7Z601	462 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	TSPY3	P0CV98	308 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	TSPY8	P0CW00	308 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	TTC22	Q5TAA0	569 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	MKL1	Q969V6	931 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	MYH4	Q9Y623	1939 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	TFAP4	Q01664	338 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	MB21D1	Q8N884	522 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	TTLL1	O95922	423 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	INHA	P05111	366 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	FGR	P09769	529 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	CCL5	P13501	91 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	USP6NL	Q92738	828 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914	INCENP	Q9NQS7	918 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD4-213	ENST00000591914		F5H6K3	240 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	ORC4	O43929	436 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	KLRC3	Q07444	240 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	MORN1	Q5T089	497 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	ATG4C	Q96DT6	458 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	RAD21	O60216	631 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	NDUFB10	O96000	172 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SMAD4-213	ENST00000591914	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		32.31	■■■□□ 2.76

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