RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588335.1

GRIN3B-202, Transcript of glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3B, humanhuman

TSL 3

Gene GRIN3B, Length 528 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3B-202ENST00000588335 C12orf42Q96LP6 360 aa16■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 CNNM2Q9H8M5 875 aa16■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 LOC285556D6RIA3 1793 aa16■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TTLL1O95922 423 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 OSBPP22059 807 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 PTH1RQ03431 593 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 ACER1Q8TDN7 264 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 ESR2Q92731 530 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 GOPCQ9HD26 462 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 NYAP2Q9P242 653 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TMX2Q9Y320 296 aa15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TLR2O60603 784 aa15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 CAP1Q01518 475 aa15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TRDNQ13061 729 aa15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TREML2Q5T2D2 321 aa15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 KRT23Q9C075 422 aa15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.98■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 A0A1W2PRG0 241 aa15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 RNF20Q5VTR2 975 aa15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 CEP95Q96GE4 821 aa15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 VCPKMTQ9H867 229 aa15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.97■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L15C9J2P7 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L11C9JVI0 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L18D6R9N7 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L22D6RA61 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L19D6RCP7 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L20D6RJB6 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 REC8O95072 547 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 VCAM1P19320 739 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L24Q0WX57 530 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 IQCA1Q86XH1 822 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 MKL1Q969V6 931 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 NBPF3Q9H094 633 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 INCENPQ9NQS7 918 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.96■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 MYH4Q9Y623 1939 aa15.96■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 GNRH1P01148 92 aa15.95■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 CYP21A2P08686 494 aa15.95■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 STX8Q9UNK0 236 aa15.95■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 NEDD4P46934 1319 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 SZT2Q5T011 3432 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 H0YGN5 161 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 RAD21O60216 631 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 CYP2C8P10632 490 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 PRMT2P55345 433 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 KIF22Q14807 665 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 TTC14Q96N46 770 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.94■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 B4E1Z4 1266 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 F5H6K3 240 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 KDM4AO75164 1064 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 KLRC3Q07444 240 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 C17orf99Q6UX52 265 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 NCOA7Q8NI08 942 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.93■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 E7EWF7 191 aa15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 HERVK_113P62684 666 aa15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 NECTIN1Q15223 517 aa15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 CPA4Q9UI42 421 aa15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.92■□□□□ 0.14
GRIN3B-202ENST00000588335 SLC27A2O14975 620 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms