RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 IGHA2P01877 340 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 CDH23Q9H251 3354 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 SEPT4O43236 478 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 ERCC3P19447 782 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 EVX2Q03828 476 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 SSH3Q8TE77 659 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PRG0 241 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 IGSF3O75054 1194 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 COBLO75128 1261 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 PLS1Q14651 629 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 SNX17Q15036 470 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 CERS3Q8IU89 383 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CCDC40-211ENST00000574099 FOSL2P15408 326 aa21.32■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 COG2Q14746 738 aa21.32■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC41Q15345 812 aa21.32■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 MYH8P13535 1937 aa21.31■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 STRNO43815 780 aa21.31■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 ATP8B2P98198 1209 aa21.31■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 MAP3K12Q12852 859 aa21.31■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.31■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.31■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 PARP14Q460N5 1801 aa21.3■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 TLE2Q04725 743 aa21.3■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.3■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.3■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 ITGB8P26012 769 aa21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 GABPAQ06546 454 aa21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 ATG4CQ96DT6 458 aa21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 MAML3Q96JK9 1138 aa21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.29■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.28■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.28■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 EPHB4P54760 987 aa21.28■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.28■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.28■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.27■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 FLOT1O75955 427 aa21.27■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 DSG3P32926 999 aa21.27■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 MROH8Q9H579 483 aa21.27■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.27■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.27■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCDC40-211ENST00000574099 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 PGK1P00558 417 aa21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 CLTBP09497 229 aa21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 CYP2D6P10635 497 aa21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 MB21D1Q8N884 522 aa21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 PHF24Q9UPV7 400 aa21.26■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 RARBP10826 455 aa21.25■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 FCER1AP12319 257 aa21.25■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.25■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 AACSQ86V21 672 aa21.25■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.25■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.25■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 PGK2P07205 417 aa21.24■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 RAG1P15918 1043 aa21.24■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.24■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 USP38Q8NB14 1042 aa21.24■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.24■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 PDE6AP16499 860 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 ICA1Q05084 483 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 RNF180Q86T96 592 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 LCORLQ8N3X6 602 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 MMP19Q99542 508 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.23■□□□□ 0.99
CCDC40-211ENST00000574099 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms