RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 TANGO6Q9C0B7 1094 aa36.3■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SOCS4Q8WXH5 440 aa36.29■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-206ENST00000571409 IFNL3Q8IZI9 196 aa36.27■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-206ENST00000571409 MKNK2Q9HBH9 465 aa36.27■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-206ENST00000571409 WDR78Q5VTH9 848 aa36.23■■■■□ 3.39
CTDNEP1-206ENST00000571409 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa36.23■■■■□ 3.39
CTDNEP1-206ENST00000571409 USP6NLQ92738 828 aa36.23■■■■□ 3.39
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEFB118Q96PH6 123 aa36.23■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF287Q9HBT7 754 aa36.2■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-206ENST00000571409 MYH4Q9Y623 1939 aa36.11■■■■□ 3.37
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SHCBP1Q8NEM2 672 aa36.11■■■■□ 3.37
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ERCC3P19447 782 aa36.1■■■■□ 3.37
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