RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHD	P01880	384 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	RASA1	P20936	1047 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	LPAR1	Q92633	364 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	USP6NL	Q92738	828 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	EVI5L	Q96CN4	794 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	LNPK	Q9C0E8	428 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	SH2D4A	Q9H788	454 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	VCPKMT	Q9H867	229 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD7	Q9P203	1132 aa		26.05	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JMZ2	1700 aa		26.04	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP14	Q460N5	1801 aa		26.04	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	26.04	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	TDO2	P48775	406 aa		26.04	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR142	Q7Z601	462 aa		26.04	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		26.04	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	26.04	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	APP	P05067	770 aa		26.03	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	26.03	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	COG2	Q14746	738 aa		26.03	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	MORN1	Q5T089	497 aa		26.03	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		26.03	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	26.03	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		26.03	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXP2	O15409	715 aa		26.02	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGCR	P04035	888 aa		26.02	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		26.02	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		26.02	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	26.02	■■□□□ 1.76
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNA1	P78396	465 aa		26.01	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		26.01	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		26.01	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIB2	Q92519	343 aa		26.01	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		26.01	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		26.01	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		26.01	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SGPL1	O95470	568 aa		26	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2B6	P20813	491 aa		26	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NUCB1	Q02818	461 aa		26	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		26	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		26	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TICAM2	Q86XR7	235 aa		26	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	25.99	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM32	Q13049	653 aa		25.99	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		25.99	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	25.99	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		25.98	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DSG3	P32926	999 aa		25.98	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2B2	Q01814	1243 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB118	Q96PH6	123 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NYAP2	Q9P242	653 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDM1	O75626	825 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	FLOT1	O75955	427 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS2	P41220	211 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PPARA	Q07869	468 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MB21D1	Q8N884	522 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NAPB	Q9H115	298 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	GOPC	Q9HD26	462 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		25.97	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RPTOR	Q8N122	1335 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH4	Q9Y623	1939 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN2	P17655	700 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRE	P23469	700 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP2K5	Q13163	448 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS53	Q5VIR6	699 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG4C	Q96DT6	458 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	APBA2	Q99767	749 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		25.96	■■□□□ 1.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		25.95	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	GRB14	Q14449	540 aa		25.95	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL14	Q16627	93 aa		25.95	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	25.95	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM227B	Q96M60	508 aa		25.95	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		25.94	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	25.94	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0D9SFI3	127 aa		25.94	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		25.94	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	MKL1	Q969V6	931 aa		25.94	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	25.93	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXC6	P09630	235 aa		25.93	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE4B	Q07343	736 aa		25.93	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP95	Q96GE4	821 aa		25.93	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	25.93	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	25.93	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		25.93	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		25.93	■■□□□ 1.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		25.93	■■□□□ 1.74

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