RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF112Q9UJU3 913 aa27.83■■■□□ 2.05
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MEIS3-204ENST00000558555 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
MEIS3-204ENST00000558555 CDCA5Q96FF9 252 aa27.82■■■□□ 2.04
MEIS3-204ENST00000558555 WRNIP1Q96S55 665 aa27.82■■■□□ 2.04
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MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.82■■■□□ 2.04
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MEIS3-204ENST00000558555 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
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MEIS3-204ENST00000558555 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.79■■■□□ 2.04
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MEIS3-204ENST00000558555 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.78■■■□□ 2.04
MEIS3-204ENST00000558555 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.78■■■□□ 2.04
MEIS3-204ENST00000558555 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.78■■■□□ 2.04
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MEIS3-204ENST00000558555 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
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MEIS3-204ENST00000558555 DDIT3P35638 169 aa27.76■■■□□ 2.03
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MEIS3-204ENST00000558555 FZD1Q9UP38 647 aa27.76■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 USP17L5A8MUK1 530 aa27.75■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 RAD21O60216 631 aa27.75■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 DTNBO60941 627 aa27.75■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
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MEIS3-204ENST00000558555 TMTC3Q6ZXV5 915 aa27.75■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.75■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
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MEIS3-204ENST00000558555 ASPRV1Q53RT3 343 aa27.75■■■□□ 2.03
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MEIS3-204ENST00000558555 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHA8P1O95397 391 aa27.73■■■□□ 2.03
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MEIS3-204ENST00000558555 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.73■■■□□ 2.03
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MEIS3-204ENST00000558555 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.72■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.72■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 KLRF2D3W0D1 207 aa27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 TRAF5O00463 557 aa27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 ECE1P42892 770 aa27.71■■■□□ 2.03
MEIS3-204ENST00000558555 SLC1A4P43007 532 aa27.71■■■□□ 2.03
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