RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 WRNIP1Q96S55 665 aa20.25■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 CABP5Q9NP86 173 aa20.25■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.25■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 TRAF5O00463 557 aa20.24■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 SNHG28P0DPA3 235 aa20.24■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 GJB2P29033 226 aa20.24■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 PRKG1Q13976 671 aa20.24■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.24■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.24■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.832e-12■□□□□ 9.8
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LGMN-216ENST00000557434 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.24■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 PDHBP11177 359 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 ATP2B2Q01814 1243 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 GRM4Q14833 912 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 NBPF11Q86T75 865 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 HOOK2Q96ED9 719 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 MTMR7Q9Y216 660 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 MYH6P13533 1939 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 USP17L5A8MUK1 530 aa20.23■□□□□ 0.83
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LGMN-216ENST00000557434 MOB2Q70IA6 237 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 PHKBQ93100 1093 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 DDX11Q96FC9 970 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 MAP3K14Q99558 947 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.23■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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LGMN-216ENST00000557434 CALM2P0DP24 149 aa20.22■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 CALM3P0DP25 149 aa20.22■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.22■□□□□ 0.83
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LGMN-216ENST00000557434 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.22■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 LDHDQ86WU2 507 aa20.22■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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LGMN-216ENST00000557434 IFNAR1P17181 557 aa20.21■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.21■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.21■□□□□ 0.83
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LGMN-216ENST00000557434 TMX2Q9Y320 296 aa20.21■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.21■□□□□ 0.83
LGMN-216ENST00000557434 CPLX1O14810 134 aa20.2■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 CYTH3O43739 400 aa20.2■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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LGMN-216ENST00000557434 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.2■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 PTPRAP18433 802 aa20.19■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 VGLL4Q14135 290 aa20.19■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.19■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.19■□□□□ 0.82
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LGMN-216ENST00000557434 NDUFB10O96000 172 aa20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 KLRC3Q07444 240 aa20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 MAP3K11Q16584 847 aa20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 GINM1Q9NU53 330 aa20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 SYT1P21579 422 aa20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 ZNF543Q08ER8 600 aa20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 DGKZQ13574 1117 aa20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.17■□□□□ 0.82
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LGMN-216ENST00000557434 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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LGMN-216ENST00000557434 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 KIF5BP33176 963 aa20.17■□□□□ 0.82
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LGMN-216ENST00000557434 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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LGMN-216ENST00000557434 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.17■□□□□ 0.82
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LGMN-216ENST00000557434 KLRF2D3W0D1 207 aa20.16■□□□□ 0.82
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LGMN-216ENST00000557434 KCTD1Q719H9 257 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 STK36Q9NRP7 1315 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 GMCL1Q96IK5 515 aa20.16■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 CDKL5O76039 1030 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.15■□□□□ 0.82
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