RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNNI2	P48788	182 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	NYAP2	Q9P242	653 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	FIBP	O43427	364 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	SNHG28	P0DPA3	235 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAP3K10	Q02779	954 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	MKL1	Q969V6	931 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	29.79	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF28P	B7ZC32	967 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMARCA1	P28370	1054 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	CFAP45	Q9UL16	551 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	SBF1	O95248	1867 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	ELP1	O95163	1332 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	TCHH	Q07283	1943 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	MMP1	P03956	469 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	GPT2	Q8TD30	523 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676		H7C1D1	291 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	MBD3	O95983	291 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDHB	P11177	359 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP17L5	A8MUK1	530 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	KLRF2	D3W0D1	207 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	XBP1	P17861	261 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	RASA3	Q14644	834 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	SHISA4	Q96DD7	197 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	SCG2	P13521	617 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	JAG1	P78504	1218 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEPT2	Q15019	361 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYTH3	O43739	400 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	GDF11	O95390	407 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBE2H	P62256	183 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	MTMR7	Q9Y216	660 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPATA32	Q96LK8	384 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	TEPSIN	Q96N21	525 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	CABP5	Q9NP86	173 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	GH2	P01242	217 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	RNF181	Q9P0P0	153 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	HACL1	Q9UJ83	578 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP28	Q96RU2	1077 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYH6	P13533	1939 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	ICA1	Q05084	483 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF543	Q08ER8	600 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP2B2	Q01814	1243 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP1CC-208	ENST00000551676	BTBD18	B2RXH4	712 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	NPY5R	Q15761	445 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP1CC-208	ENST00000551676	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		29.68	■■■□□ 2.34

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