RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 USP17L12C9JPN9 530 aa34.25■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 USP17L21D6R901 530 aa34.25■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 EVI5O60447 810 aa34.25■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 PTPREP23469 700 aa34.25■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP34.25■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 DCTPP1Q9H773 170 aa34.25■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 CDK8P49336 464 aa34.24■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 LAMA3Q16787 3333 aa34.24■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 CCNA1P78396 465 aa34.23■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 MYH8P13535 1937 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 SLC15A5A6NIM6 579 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 HOXC6P09630 235 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 GRB14Q14449 540 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 COG2Q14746 738 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 CTR9Q6PD62 1173 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 C16orf86Q6ZW13 317 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 NBPF3Q9H094 633 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 TMX2Q9Y320 296 aa34.22■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 NPLOC4Q8TAT6 608 aa34.21■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 ECHDC1Q9NTX5 307 aa34.21■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 PFASO15067 1338 aa34.21■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 A0A0G2JMZ2 1700 aa34.21■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa34.2■■■■□ 3.07
ACER3-214ENST00000534206 COL6A1P12109 1028 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 TSHZ3Q63HK5 1081 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 HOXC10Q9NYD6 342 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 CCDC17Q96LX7 622 aa34.18■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 C11orf49Q9H6J7 331 aa34.18■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 PARP14Q460N5 1801 aa34.18■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 DSG3P32926 999 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 ICA1Q05084 483 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 WDR78Q5VTH9 848 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 OSBP2Q969R2 916 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 VCPKMTQ9H867 229 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 STAP2Q9UGK3 403 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 SPICE1Q8N0Z3 855 aa34.16■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 LPAR1Q92633 364 aa34.16■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 TANGO6Q9C0B7 1094 aa34.16■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 SPATC1LQ9H0A9 340 aa34.16■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa34.16■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 GSG1L2A8MUP6 293 aa34.15■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa34.15■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 KBTBD3Q8NAB2 608 aa34.15■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 TRPV1Q8NER1 839 aa34.15■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 DNAH12Q6ZR08 3092 aa34.15■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 C7orf61Q8IZ16 206 aa34.14■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 ATG4CQ96DT6 458 aa34.14■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 FRMPD3Q5JV73 1810 aa34.14■■■■□ 3.06
ACER3-214ENST00000534206 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 EEF2P13639 858 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 GDF15Q99988 308 aa34.13■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa34.13■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 ZNF236Q9UL36 1845 aa34.13■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 ERCC3P19447 782 aa34.12■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 CYP2C19P33261 490 aa34.12■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 SBK1Q52WX2 424 aa34.12■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 SHCBP1Q8NEM2 672 aa34.12■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa34.12■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 COBLO75128 1261 aa34.11■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 ADORA2AP29274 412 aa34.11■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 MFSD14CQ5VZR4 134 aa34.11■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa34.11■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 FLOT1O75955 427 aa34.1■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 MB21D1Q8N884 522 aa34.1■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 KANSL2Q9H9L4 492 aa34.1■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 WDR46O15213 610 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 ATP2B2Q01814 1243 aa34.09■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 APPBP2Q92624 585 aa34.09■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 FBXO28Q9NVF7 368 aa34.09■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 A0A1W2PPC1 479 aa34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 STRNO43815 780 aa34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 CYBAP13498 195 aa34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 RASA1P20936 1047 aa34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 TMEM132BQ14DG7 1078 aa34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
ACER3-214ENST00000534206 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 LRRC26Q2I0M4 334 aa34.07■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 GIMAP6Q6P9H5 292 aa34.07■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 AMOTL1Q8IY63 956 aa34.07■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 SH2D4AQ9H788 454 aa34.07■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 M0R2C6 588 aa34.06■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 SYN1P17600 705 aa34.06■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 BMP8BP34820 402 aa34.06■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 OLFML2BQ68BL8 750 aa34.06■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 PI4K2BQ8TCG2 481 aa34.06■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 DDRGK1Q96HY6 314 aa34.06■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
ACER3-214ENST00000534206 DPP9Q86TI2 863 aa34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms