RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 TMX2Q9Y320 296 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 GNRH1P01148 92 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 ELNP15502 786 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 MTFR1Q15390 333 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 IL25Q9H293 177 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 VCPKMTQ9H867 229 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 BTBD7Q9P203 1132 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 BRCA2P51587 3418 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 HOXD10P28358 340 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 PRMT2P55345 433 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 ERVK-9P63128 1117 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 ERVK-24P63145 666 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 RAD21O60216 631 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 GRK4P32298 578 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 TTC22Q5TAA0 569 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 LAMA4Q16363 1823 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 HAND2P61296 217 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 CEP95Q96GE4 821 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 GJD2Q9UKL4 321 aa22.34■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 ADCY3O60266 1144 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 FGAP02671 866 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 COA7Q96BR5 231 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 ATG4CQ96DT6 458 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 NBPF3Q9H094 633 aa22.33■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 NMT2O60551 498 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 TFAP4Q01664 338 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM32Q13049 653 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 SH2D4AQ9H788 454 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.32■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 FLOT1O75955 427 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 ALX1Q15699 326 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 NBPF11Q86T75 865 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 LPAR1Q92633 364 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 NDUFB10O96000 172 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 TSPY3P0CV98 308 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 TSPY8P0CW00 308 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 CYP2B6P20813 491 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 DSG3P32926 999 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 PDE4BQ07343 736 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 COG2Q14746 738 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 LBX2Q6XYB7 198 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 GPR142Q7Z601 462 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 NYAP2Q9P242 653 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 INHAP05111 366 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 IRF5Q13568 498 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 WDR78Q5VTH9 848 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 GOPCQ9HD26 462 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 CCL5P13501 91 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 SHISA4Q96DD7 197 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 F5H6K3 240 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 MAPK4P31152 587 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 KLRC3Q07444 240 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 CCL14Q16627 93 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-211ENST00000529899 MORN1Q5T089 497 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms