RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 SHTN1A0MZ66 631 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 TULP2O00295 520 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 MBD3O95983 291 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 HLA-DOAP06340 250 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 AKR1B1P15121 316 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 GABPAQ06546 454 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 KRT40Q6A162 431 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 CEP95Q96GE4 821 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 GMLQ99445 158 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 DDAH1O94760 285 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 CALM1P0DP23 149 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 CALM2P0DP24 149 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 CALM3P0DP25 149 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 DLGAP5Q15398 846 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 TERF2Q15554 542 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG13-211ENST00000528494 KIF28PB7ZC32 967 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 RCAN1P53805 252 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 TRIM29Q14134 588 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SPATA32Q96LK8 384 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 VPS33BQ9H267 617 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SPDYE6P0CI01 402 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SHMT1P34896 483 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 UVSSAQ2YD98 709 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 IDI2Q9BXS1 227 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 MYH1P12882 1939 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 NID2Q14112 1375 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 PRELPP51888 382 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 VEZTQ9HBM0 779 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SPON1Q9HCB6 807 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 DEXIO95424 95 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 ATP2B2Q01814 1243 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 FUT2Q10981 343 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 PPP2R5BQ15173 497 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 USP28Q96RU2 1077 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 DNAJC18Q9H819 358 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 CAPN2P17655 700 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SYCP1Q15431 976 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 WASF1Q92558 559 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 CPVLQ9H3G5 476 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 STK36Q9NRP7 1315 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 UBE2HP62256 183 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 ANKS1AQ92625 1134 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SWAP70Q9UH65 585 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 KIF5BP33176 963 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 PKN1Q16512 942 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 CSRNP1Q96S65 589 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-211ENST00000528494 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms