RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 MYH6P13533 1939 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 TTLL1O95922 423 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 CAP2P40123 477 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 SYT1P21579 422 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 TMTC2Q8N394 836 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 WRNIP1Q96S55 665 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 MTA3Q9BTC8 594 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.08■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.08■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC17Q96LX7 622 aa18.08■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.08■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.08■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
TRPS1-206ENST00000517323 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.08■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 TBC1D12O60347 775 aa18.08■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 TOP1P11387 765 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 MAP3K10Q02779 954 aa18.08■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 ANKS1AQ92625 1134 aa18.08■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 NOVP48745 357 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 KCTD1Q719H9 257 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CABP5Q9NP86 173 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 OTOFQ9HC10 1997 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 FERMT3Q86UX7 667 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CDCA5Q96FF9 252 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 DDAH1O94760 285 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 PDHBP11177 359 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 SLC16A2P36021 539 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 FUT2Q10981 343 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 IL27Q8NEV9 243 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 VAT1LQ9HCJ6 419 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.06■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 DOCK1Q14185 1865 aa18.05■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CYTH3O43739 400 aa18.05■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 TMTC3Q6ZXV5 915 aa18.05■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.05■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 SHISA4Q96DD7 197 aa18.05■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 GRM4Q14833 912 aa18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 KLRG1Q96E93 195 aa18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 NID2Q14112 1375 aa18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 STX6O43752 255 aa18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 SNAP25P60880 206 aa18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.04■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 KLRF2D3W0D1 207 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 F5H6K3 240 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 KLRC3Q07444 240 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC96Q2M329 555 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 NYAP2Q9P242 653 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 TCHHQ07283 1943 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFB10O96000 172 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 IFNAR1P17181 557 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 HOMER1Q86YM7 354 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 MTMR6Q9Y217 621 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.02■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 DCAF15Q66K64 600 aa18.02■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 SLFN13Q68D06 897 aa18.02■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.02■□□□□ 0.48
TRPS1-206ENST00000517323 SMCHD1A6NHR9 2005 aa18.02■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM75PA6NK02 468 aa18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTS3O15072 1205 aa18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 ASNSP08243 561 aa18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 CALM1P0DP23 149 aa18.01■□□□□ 0.47
TRPS1-206ENST00000517323 CALM2P0DP24 149 aa18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms