RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF141Q8WVD5 230 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF19AQ9NV58 838 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL3Q9UH77 587 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEMA7AO75326 666 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 BMP7P18075 431 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXA5P20719 270 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SP110Q9HB58 689 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 F6X3S4 739 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 GALK1P51570 392 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMD2Q13200 908 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR0B2Q15466 257 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIRT2Q8IXJ6 389 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHC3Q8NDX5 983 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SGPP1Q9BX95 441 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFXAPO00287 272 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PEX10O60683 326 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX17Q15036 470 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF385BQ569K4 471 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHISA3A0PJX4 238 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR14I1A6ND48 311 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRIN3BO60391 1043 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSPNO60542 156 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEKQ02763 1124 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADGRF1Q5T601 910 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLFN12Q8IYM2 578 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 RELTQ969Z4 430 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASPNQ9BXN1 380 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARP2Q9UGN5 583 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCTD3Q9Y597 815 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 CILPO75339 1184 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 F13A1P00488 732 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 GBP1P32455 592 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC14A2Q15849 920 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 EBF1Q9UH73 591 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 PF4P02776 101 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMNB2Q03252 620 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 C20orf173Q96LM9 149 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIF2CQ99661 725 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 HTR3BO95264 441 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLECQ14165 292 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 SSPNQ14714 243 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 RELL1Q8IUW5 271 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM161BQ96MY7 647 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCM1Q9NP62 436 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRAK3Q9Y616 596 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM221AA4D161 298 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 PI3P19957 117 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHISA4Q96DD7 197 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms