RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 EVC2Q86UK5 1308 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 AKAP12Q02952 1782 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 ARNTP27540 789 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 EVA1CP58658 441 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 RNF208Q9H0X6 261 aa9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 COL18A1P39060 1754 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 UNCXA6NJT0 531 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 ITGB2P05107 769 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 CELA3AP09093 270 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 Q6ZS46 218 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 PAGE1O75459 146 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 RLBP1P12271 317 aa9.59□□□□□ -0.87
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PDE4D-222ENST00000514552 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 PDZD3Q86UT5 571 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 KRT82Q9NSB4 513 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 NFAT5O94916 1531 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM37O94972 964 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 ALX3O95076 343 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 ECEL1O95672 775 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 DLGAP3O95886 979 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 CTSBP07858 339 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 BMP6P22004 513 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 GATA4P43694 442 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 STK35Q8TDR2 534 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 BACH2Q9BYV9 841 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 USP35Q9P2H5 1018 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC14Q15048 493 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 CEP41Q9BYV8 373 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC7Q96M83 1385 aa9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-222ENST00000514552 PDE3AQ14432 1141 aa9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-222ENST00000514552 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 SBF2Q86WG5 1849 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 PLSCR1O15162 318 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-222ENST00000514552 GLB1P16278 677 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-222ENST00000514552 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 TNS2Q63HR2 1409 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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PDE4D-222ENST00000514552 FDX2Q6P4F2 183 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.54□□□□□ -0.88
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PDE4D-222ENST00000514552 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 MSTNO14793 375 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 RASIP1Q5U651 963 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF428Q96B54 188 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 RAD18Q9NS91 495 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 UTRNP46939 3433 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-222ENST00000514552 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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