RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-223ENST00000512131 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 RAD50Q92878 1312 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 ADCY3O60266 1144 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 FGRP09769 529 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 FLT3LGP49771 235 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 TREML2Q5T2D2 321 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 ACER1Q8TDN7 264 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 C12orf42Q96LP6 360 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 MYH8P13535 1937 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 SGPL1O95470 568 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 ELNP15502 786 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 A0A1W2PRG0 241 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 INHAP05111 366 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 PDE4BQ07343 736 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 IRF5Q13568 498 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 USP14P54578 494 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 A0A0C4DFX4 3053 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 SGSM2O43147 1006 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 PRDM1O75626 825 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 ICA1Q05084 483 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 FEZ1Q99689 392 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 NBPF3Q9H094 633 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 TMX2Q9Y320 296 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP2-223ENST00000512131 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 ORC4O43929 436 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 DEFB118Q96PH6 123 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 COL6A3P12111 3177 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 CAPN2P17655 700 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 INCENPQ9NQS7 918 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 PNMA3Q9UL41 463 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 EVI5O60447 810 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 VCAM1P19320 739 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 NYAP2Q9P242 653 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 MGAMO43451 1857 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 HAND2P61296 217 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 TFAP4Q01664 338 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 COA7Q96BR5 231 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 SH2D4AQ9H788 454 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 A0A1W2PPC1 479 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF213O14771 459 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 TSPY3P0CV98 308 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 TSPY8P0CW00 308 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 LPAR1Q92633 364 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 MKL1Q969V6 931 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 CEP95Q96GE4 821 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 VCPKMTQ9H867 229 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L15C9J2P7 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L11C9JVI0 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L18D6R9N7 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L22D6RA61 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L19D6RCP7 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 USP17L20D6RJB6 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP2-223ENST00000512131 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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