RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 KANSL2Q9H9L4 492 aa29.7■■■□□ 2.35
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 SKAP1Q86WV1 359 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 SH2D4AQ9H788 454 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.69■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 DOCK3Q8IZD9 2030 aa29.68■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 EEF2P13639 858 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 GABRQQ9UN88 632 aa29.68■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 ZMYM6O95789 1325 aa29.68■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 GRK4P32298 578 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 TMX2Q9Y320 296 aa29.67■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 FLT3LGP49771 235 aa29.66■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.66■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.66■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 INCENPQ9NQS7 918 aa29.65■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 TSPY3P0CV98 308 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 TSPY8P0CW00 308 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 HAND2P61296 217 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 SLAIN1Q8ND83 568 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 IL25Q9H293 177 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 VCPKMTQ9H867 229 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 MYH4Q9Y623 1939 aa29.64■■■□□ 2.34
CXCL3-202ENST00000502974 POTEFA5A3E0 1075 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 CHMLP26374 656 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 ERVK-9P63128 1117 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 ERVK-24P63145 666 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 TFAP4Q01664 338 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 LPAR1Q92633 364 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.63■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 LAMA4Q16363 1823 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 ADCY3O60266 1144 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 PEX10O60683 326 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 IRF5Q13568 498 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 NYAP2Q9P242 653 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 RAD50Q92878 1312 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.62■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 RAD21O60216 631 aa29.61■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 CEP95Q96GE4 821 aa29.61■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.61■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 GOPCQ9HD26 462 aa29.61■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 TOMM22Q9NS69 142 aa29.61■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.61■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 TSPY2A6NKD2 308 aa29.6■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 UBXN2AP68543 259 aa29.6■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.6■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 ORC4O43929 436 aa29.59■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 MAPK4P31152 587 aa29.59■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.59■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 CCNA1P78396 465 aa29.58■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 COG2Q14746 738 aa29.58■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 LBX2Q6XYB7 198 aa29.58■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 PXYLP1Q8TE99 480 aa29.58■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 NBPF3Q9H094 633 aa29.58■■■□□ 2.33
CXCL3-202ENST00000502974 BRCA2P51587 3418 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF213O14771 459 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 TTLL1O95922 423 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 FGRP09769 529 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 ELNP15502 786 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 Q3C1V9 767 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 POTEEQ6S8J3 1075 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.57■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 MTFR1Q15390 333 aa29.56■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.56■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.56■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 SOCS4Q8WXH5 440 aa29.56■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 PORCNQ9H237 461 aa29.56■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 RLFQ13129 1914 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 CNMDO75829 334 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 FLOT1O75955 427 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.55■■■□□ 2.32
CXCL3-202ENST00000502974 GJD2Q9UKL4 321 aa29.55■■■□□ 2.32
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