RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497811.5

LINC00635-208, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00635, Length 856 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-208ENST00000497811 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.25□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.25□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 PPT2Q9UMR5 302 aa9.25□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.24□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.24□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 GINM1Q9NU53 330 aa9.24□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 TNFRSF10CO14798 259 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 ESR1P03372 595 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 IMPDH2P12268 514 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 CCNFP41002 786 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 CHMP4BP1P59074 171 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 GAB4Q2WGN9 574 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 GPRASP2Q96D09 838 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 SLC9A7Q96T83 725 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.23□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 RNF4P78317 190 aa9.22□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 TMEM192Q8IY95 271 aa9.22□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.22□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.22□□□□□ -0.93
LINC00635-208ENST00000497811 SHISA3A0PJX4 238 aa9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 PAPLNO95428 1278 aa9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ACRP10323 421 aa9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 GJA8P48165 433 aa9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 SPATA32Q96LK8 384 aa9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.21□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 CLEC3AO75596 197 aa9.2□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 SOX9P48436 509 aa9.2□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.2□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 CREG2Q8IUH2 290 aa9.2□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 SLC6A18Q96N87 628 aa9.2□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.19□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.19□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 TM9SF2Q99805 663 aa9.19□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 DUSP13Q9UII6 198 aa9.19□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.18□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 BIN1O00499 593 aa9.17□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 TCF3P15923 654 aa9.17□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.17□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 PAX4O43316 350 aa9.16□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 EGR3Q06889 387 aa9.16□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.16□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.16□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.16□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.16□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.16□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 GUCY2CP25092 1073 aa9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 HDAC8Q9BY41 377 aa9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
LINC00635-208ENST00000497811 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 LTKP29376 864 aa9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 GDNFP39905 211 aa9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 ASIC4Q96FT7 647 aa9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 CRBNQ96SW2 442 aa9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 C9IYK1 514 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 GIPRP48546 466 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 RNF114Q9Y508 228 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LINC00635-208ENST00000497811 FYB2Q5VWT5 728 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms