RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ORC4	O43929	436 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NMT2	O60551	498 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CAP1	Q01518	475 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	LAMA4	Q16363	1823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NEDD4	P46934	1319 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CDC45	O75419	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	TTLL1	O95922	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	BCR	P11274	1271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	HERVK_113	P62684	666 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	KIF22	Q14807	665 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NYAP2	Q9P242	653 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024		B4E1Z4	1266 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024		F5H6K3	240 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	FGR	P09769	529 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	PSMC4	P43686	418 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	KLRC3	Q07444	240 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	MGAM	O43451	1857 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	KDM4A	O75164	1064 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	FLOT1	O75955	427 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	NDUFB10	O96000	172 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CTGF	P29279	349 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	COG2	Q14746	738 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	LPAR1	Q92633	364 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ESR2	Q92731	530 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CAPN15	O75808	1086 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	CYP21A2	P08686	494 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGEF6	Q15052	776 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	POTED	Q86YR6	584 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	MKL1	Q969V6	931 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CALD1-223	ENST00000496024	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	MCC	P23508	829 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	FCGRT	P55899	365 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	ERVK-24	P63145	666 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	PLS1	Q14651	629 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024		Q3C1V9	767 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	KRT23	Q9C075	422 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	RLF	Q13129	1914 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024		E7EWF7	191 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	CNMD	O75829	334 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	DSG3	P32926	999 aa		11.57	□□□□□ -0.56
CALD1-223	ENST00000496024	SLC1A4	P43007	532 aa		11.57	□□□□□ -0.56

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