RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 HOXA5P20719 270 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 DUSP4Q13115 394 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 SNX17Q15036 470 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.13□□□□□ -1.11
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ITGA4-211ENST00000490435 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.13□□□□□ -1.11
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ITGA4-211ENST00000490435 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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ITGA4-211ENST00000490435 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.13□□□□□ -1.11
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ITGA4-211ENST00000490435 C20orf173Q96LM9 149 aa8.11□□□□□ -1.11
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ITGA4-211ENST00000490435 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ITGA4-211ENST00000490435 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.09□□□□□ -1.11
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ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.08□□□□□ -1.12
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ITGA4-211ENST00000490435 CHMP4BP1P59074 171 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 LMNB2Q03252 620 aa8.06□□□□□ -1.12
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ITGA4-211ENST00000490435 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.05□□□□□ -1.12
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ITGA4-211ENST00000490435 PARP2Q9UGN5 583 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 F13A1P00488 732 aa8.04□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 GALK1P51570 392 aa8.04□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 ADGRF1Q5T601 910 aa8.04□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.04□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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ITGA4-211ENST00000490435 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 NLRX1Q86UT6 975 aa8.03□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.03□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.03□□□□□ -1.12
ITGA4-211ENST00000490435 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.02□□□□□ -1.13
ITGA4-211ENST00000490435 NOTOA8MTQ0 251 aa8.02□□□□□ -1.13
ITGA4-211ENST00000490435 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
ITGA4-211ENST00000490435 GBP1P32455 592 aa8.02□□□□□ -1.13
ITGA4-211ENST00000490435 DAB2P98082 770 aa8.02□□□□□ -1.13
ITGA4-211ENST00000490435 SSPNQ14714 243 aa8.02□□□□□ -1.13
ITGA4-211ENST00000490435 SLC14A2Q15849 920 aa8.02□□□□□ -1.13
ITGA4-211ENST00000490435 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
ITGA4-211ENST00000490435 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.02□□□□□ -1.13
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