RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.69□□□□□ -1.34
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CNN3-206ENST00000487539 FAM170BA6NMN3 283 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-206ENST00000487539 GPR182O15218 404 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-206ENST00000487539 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CNN3-206ENST00000487539 NLRP12P59046 1061 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-206ENST00000487539 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-206ENST00000487539 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-206ENST00000487539 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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CNN3-206ENST00000487539 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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CNN3-206ENST00000487539 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.64□□□□□ -1.35
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CNN3-206ENST00000487539 DSC3Q14574 896 aa6.62□□□□□ -1.35
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CNN3-206ENST00000487539 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
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