RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486268.5

ERGIC3-215, Transcript of ERGIC and golgi 3, human

TSL 2

Gene ERGIC3, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERGIC3-215	ENST00000486268	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	FUT2	Q10981	343 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ERGIC3-215	ENST00000486268	ENTPD3	O75355	529 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	YEATS4	O95619	227 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	MRE11	P49959	708 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	EVX2	Q03828	476 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PICALM	Q13492	652 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GRM4	Q14833	912 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	NMT2	O60551	498 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TOMM70	O94826	608 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	MMP1	P03956	469 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	FOSB	P53539	338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TCHH	Q07283	1943 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	CACNB3	P54284	484 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268		A0A1W2PQ27	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268		A0A1W2PQ64	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268		A0A1W2PQD8	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	NFIA	Q12857	509 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	STK38	Q15208	465 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PKN1	Q16512	942 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ERGIC3-215	ENST00000486268	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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