RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 ICA1Q05084 483 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SBK1Q52WX2 424 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 MORN1Q5T089 497 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 FSD1Q9BTV5 496 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 TMX2Q9Y320 296 aa15.6■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 PRDM1O75626 825 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 RASA1P20936 1047 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 MAPK4P31152 587 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 COG2Q14746 738 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 CCDC17Q96LX7 622 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.58■□□□□ 0.09
HPS1-211ENST00000478087 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FOXP2O15409 715 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 HMGCRP04035 888 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 PDE1AP54750 535 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 WDR78Q5VTH9 848 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 LBX2Q6XYB7 198 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 LNPKQ9C0E8 428 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.086e-7■■■■□ 21.6
HPS1-211ENST00000478087 VCPKMTQ9H867 229 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 INCENPQ9NQS7 918 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 STAP2Q9UGK3 403 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 DSG3P32926 999 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 TDO2P48775 406 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 NKX2-3Q8TAU0 364 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 GCC1Q96CN9 775 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 ATG4CQ96DT6 458 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 DNAH12Q6ZR08 3092 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 H0YGN5 161 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 RAD21O60216 631 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FLOT1O75955 427 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 PTPREP23469 700 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 MAP2K5Q13163 448 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 VPS53Q5VIR6 699 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 DPF3Q92784 378 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 RPTORQ8N122 1335 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.56■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 GNAT2P19087 354 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 RGS2P41220 211 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 CCNA1P78396 465 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 PLS1Q14651 629 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 SMC5Q8IY18 1101 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 LPAR1Q92633 364 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 FAM227BQ96M60 508 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
HPS1-211ENST00000478087 ERCC3P19447 782 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms