RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477057.5

FDPS-211, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FDPS, Length 741 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-211ENST00000477057 VCPKMTQ9H867 229 aa14.98□□□□□ -0.01
FDPS-211ENST00000477057 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.98□□□□□ -0.01
FDPS-211ENST00000477057 SGSM2O43147 1006 aa14.97□□□□□ -0.01
FDPS-211ENST00000477057 HERVK_113P62684 666 aa14.97□□□□□ -0.01
FDPS-211ENST00000477057 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
FDPS-211ENST00000477057 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.97□□□□□ -0.01
FDPS-211ENST00000477057 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.97□□□□□ -0.01
FDPS-211ENST00000477057 C12orf42Q96LP6 360 aa14.97□□□□□ -0.01
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FDPS-211ENST00000477057 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
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FDPS-211ENST00000477057 FLOT1O75955 427 aa14.96□□□□□ -0.01
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FDPS-211ENST00000477057 PSMC4P43686 418 aa14.96□□□□□ -0.01
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FDPS-211ENST00000477057 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.019e-12■□□□□ 8.1
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FDPS-211ENST00000477057 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.95□□□□□ -0.02
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FDPS-211ENST00000477057 BCRP11274 1271 aa14.95□□□□□ -0.02
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FDPS-211ENST00000477057 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.95□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.95□□□□□ -0.02
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FDPS-211ENST00000477057 ESR2Q92731 530 aa14.95□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
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FDPS-211ENST00000477057 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.94□□□□□ -0.02
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FDPS-211ENST00000477057 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 MYPNQ86TC9 1320 aa14.93□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.93□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 B4E1Z4 1266 aa14.93□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 F5H6K3 240 aa14.93□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 KDM4AO75164 1064 aa14.93□□□□□ -0.02
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FDPS-211ENST00000477057 HOXD10P28358 340 aa14.93□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 KLRC3Q07444 240 aa14.93□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 CCDC96Q2M329 555 aa14.93□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 SLFN13Q68D06 897 aa14.93□□□□□ -0.02
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FDPS-211ENST00000477057 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
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FDPS-211ENST00000477057 RAET1EQ8TD07 263 aa14.92□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 COA7Q96BR5 231 aa14.92□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 KRT23Q9C075 422 aa14.92□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.92□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 SLC1A4P43007 532 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 ERVK-9P63128 1117 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 ERVK-24P63145 666 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 CCNA1P78396 465 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 CAP1Q01518 475 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 PRKCZQ05513 592 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 ATG4CQ96DT6 458 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.91□□□□□ -0.02
FDPS-211ENST00000477057 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.91□□□□□ -0.02
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