RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469833.1

GLIS3-209, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 773 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-209ENST00000469833 FAM26DQ5JW98 314 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CCDC30Q5VVM6 783 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 TREML4Q6UXN2 200 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RNF217Q8TC41 542 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RILPL2Q969X0 211 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PIM2Q9P1W9 311 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 POLIQ9UNA4 740 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.93□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 NFKBIEO00221 500 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 ADCY5O95622 1261 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CTSHP09668 335 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RHOQP17081 205 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CHRNA5P30532 468 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 HSPA4P34932 840 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 TNNI2P48788 182 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PTSQ03393 145 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 DCTN1Q14203 1278 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 TBCELQ5QJ74 424 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SOGA3Q5TF21 947 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SLC4A10Q6U841 1118 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 ATCAYQ86WG3 371 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RNF214Q8ND24 703 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 FBF1Q8TES7 1133 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 XAGE2Q96GT9 111 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CSRNP1Q96S65 589 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 MEIS3Q99687 375 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 USP25Q9UHP3 1055 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 KIF3AQ9Y496 699 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 KIF20BQ96Q89 1820 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 HTTP42858 3142 aa4.92□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RASSF10A6NK89 507 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PPFIA3O75145 1194 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 LMNB1P20700 586 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 TM4SF1P30408 202 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 ARID5AQ03989 594 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CLN3Q13286 438 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SYCP1Q15431 976 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CNKSR1Q969H4 720 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 ATG3Q9NT62 314 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 DLG5Q8TDM6 1919 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 SCN11AQ9UI33 1791 aa4.91□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 AKAP11Q9UKA4 1901 aa4.9□□□□□ -1.62
GLIS3-209ENST00000469833 CCDC85CA6NKD9 419 aa4.9□□□□□ -1.63
GLIS3-209ENST00000469833 H3BM21 787 aa4.9□□□□□ -1.63
GLIS3-209ENST00000469833 STX6O43752 255 aa4.9□□□□□ -1.63
GLIS3-209ENST00000469833 PDGFAP04085 211 aa4.9□□□□□ -1.63
GLIS3-209ENST00000469833 CCDC192P0DO97 292 aa4.9□□□□□ -1.63
GLIS3-209ENST00000469833 PDCP20941 246 aa4.9□□□□□ -1.63
GLIS3-209ENST00000469833 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
GLIS3-209ENST00000469833 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms